截止2017年，農村水污染中的化學需氧量（COD）499.62萬t，氨氮（NH4+-N）24.50萬t，總氮（TN）44.65萬t，總磷（TP）3.69萬t，動植物油19.80萬t，分別占全國生活源污染物的50.80%、35.05%、30.47%、38.68%、63.93%。農業污水涉及到種植業、水產養殖業、畜禽養殖業的建制縣分別為3061個、2843個、2981個。農村水污染不僅會造成地表水富營養化，還會導致地下水硝酸鹽（NO3-）污染等問題。

農村污水特征與收集方式與城鎮污水有較大差異，處理農村水污染不僅要考慮土地資源利用和經濟效益，還要因地制宜的設計污水處理技術。我國農村污水處理技術主要分為三類：生物處理技術、生態處理技術、生物＋生態組合處理技術。

1.生物處理技術

厭氧生物處理技術是通過厭氧或兼氧微生物對可溶性和顆粒型物質進行降解，產生甲烷（CH4）和二氧化碳（CO2）等物質。水平流式三格化糞池是第一代厭氧反應器，出現于20世紀50年代，也是農村水污染最早實行的生物處理技術，利用沉降和厭氧發酵原理去除水中的懸浮性有機污染物，目前，我國有關化糞池的技術革新，主要集中于對水流狀態和填料性能的改進。

2.生態處理技術

我國生態處理技術發展于20世紀70年代，在20世紀末廣泛應用于農村水污染處理。人工濕地是對與沼澤類似的地面進行改造，將污水和污泥按一定比例投配到人工濕地上，利用根系發達的水生植物創造厭氧、兼氧、好氧的環境，實現各類微生物對污染物的降解作用，凈化水質。穩定塘是通過向人工挖掘的池塘中添加菌藻，利用水生植物、菌藻系統、微生物作用共同降解水中的污染物。穩定塘中的微生物利用藻類光合作用產生的氧進行同化作用，凈化水質，實現無動力農村污水的凈化過程。土地處理技術是通過管道設備將污水投配到天然土壤或復合土壤層中，通過沉淀、過濾、吸附和生物降解作用去除污染物。目前應用較多的有地表漫流生態處理系統、多介質土壤地下滲濾系統等。

3.生物＋生態組合處理工藝

該法生物處理單元利用好氧或厭氧微生物去除污水中的有機污染物和含N、P污染物，生態處理單元通過植物和菌藻等進一步去除污染物。由于我國農村水污染分布特點以及缺乏長期運行管理，生物＋生態組合工藝將農村污水與農業有機結合，更符合農村水污染處理因地制宜、資源化利用的原則，也是當前我國農村污水治理的重要技術。